Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms