Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms