Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd3Q8K2C9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd3Q8K2C9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd3Q8K2C9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd3Q8K2C9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd3Q8K2C9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd3Q8K2C9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd3Q8K2C9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd3Q8K2C9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd3Q8K2C9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd3Q8K2C9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd3Q8K2C9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd3Q8K2C9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd3Q8K2C9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd3Q8K2C9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hacd3Q8K2C9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms