Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Sde2Q8K1J5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sde2Q8K1J5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms