Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Alkbh3Q8K1E6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms