Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbrd1Q8K0B2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.8 ms