Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne5Q8JZW4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms