Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE3

Rcor1, REST corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcor1Q8CFE3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rcor1Q8CFE3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rcor1Q8CFE3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rcor1Q8CFE3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms