Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms