Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms