Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc17Q8CE13 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms