Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc73Q8CDM4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc73Q8CDM4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc73Q8CDM4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc73Q8CDM4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc73Q8CDM4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc73Q8CDM4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc73Q8CDM4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc73Q8CDM4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc73Q8CDM4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc73Q8CDM4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc73Q8CDM4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc73Q8CDM4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms