Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrif1Q8CDD9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrif1Q8CDD9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Lrif1Q8CDD9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrif1Q8CDD9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrif1Q8CDD9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrif1Q8CDD9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Lrif1Q8CDD9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrif1Q8CDD9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrif1Q8CDD9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrif1Q8CDD9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Lrif1Q8CDD9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrif1Q8CDD9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Lrif1Q8CDD9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrif1Q8CDD9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrif1Q8CDD9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Lrif1Q8CDD9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Lrif1Q8CDD9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Lrif1Q8CDD9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Lrif1Q8CDD9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrif1Q8CDD9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Lrif1Q8CDD9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrif1Q8CDD9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrif1Q8CDD9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrif1Q8CDD9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Lrif1Q8CDD9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrif1Q8CDD9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrif1Q8CDD9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrif1Q8CDD9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrif1Q8CDD9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrif1Q8CDD9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrif1Q8CDD9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrif1Q8CDD9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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