Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCT7

Nsun3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsun3Q8CCT7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsun3Q8CCT7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms