Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms