Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn5Q8CBA2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms