Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9L1

BC106179, BC106179 protein, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC106179Q8C9L1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC106179Q8C9L1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms