Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cwc22Q8C5N3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cwc22Q8C5N3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms