Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms