Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXT9

Sec22c, Vesicle-trafficking protein SEC22c, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22cQ8BXT9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec22cQ8BXT9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms