Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms