Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp38Q8BW70 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp38Q8BW70 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp38Q8BW70 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp38Q8BW70 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp38Q8BW70 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp38Q8BW70 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp38Q8BW70 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp38Q8BW70 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp38Q8BW70 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp38Q8BW70 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp38Q8BW70 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp38Q8BW70 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp38Q8BW70 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp38Q8BW70 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp38Q8BW70 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp38Q8BW70 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp38Q8BW70 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp38Q8BW70 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp38Q8BW70 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp38Q8BW70 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp38Q8BW70 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp38Q8BW70 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms