Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII1

Prox2, Prospero homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox2Q8BII1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox2Q8BII1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox2Q8BII1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox2Q8BII1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox2Q8BII1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox2Q8BII1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox2Q8BII1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox2Q8BII1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox2Q8BII1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox2Q8BII1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox2Q8BII1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox2Q8BII1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox2Q8BII1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox2Q8BII1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox2Q8BII1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox2Q8BII1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox2Q8BII1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms