Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHK2

Scn3b, Sodium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3bQ8BHK2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn3bQ8BHK2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms