Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Clrn3Q8BHH8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Clrn3Q8BHH8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Clrn3Q8BHH8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Clrn3Q8BHH8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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