Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smndc1Q8BGT7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms