Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg4bQ8BGE6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Atg4bQ8BGE6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Atg4bQ8BGE6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Atg4bQ8BGE6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Atg4bQ8BGE6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Atg4bQ8BGE6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4bQ8BGE6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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