Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt12Q8BG71 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms