Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms