Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG19

Tmtc4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc4Q8BG19 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmtc4Q8BG19 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmtc4Q8BG19 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmtc4Q8BG19 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmtc4Q8BG19 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmtc4Q8BG19 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmtc4Q8BG19 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmtc4Q8BG19 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmtc4Q8BG19 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmtc4Q8BG19 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmtc4Q8BG19 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmtc4Q8BG19 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmtc4Q8BG19 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmtc4Q8BG19 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmtc4Q8BG19 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms