Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms