Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NanogQ80Z64 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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