Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc27Q80YS5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms