Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrfn4Q80XU8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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