Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Zbed4Q80WQ9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Zbed4Q80WQ9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Zbed4Q80WQ9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Zbed4Q80WQ9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Zbed4Q80WQ9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Zbed4Q80WQ9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Zbed4Q80WQ9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Zbed4Q80WQ9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Zbed4Q80WQ9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Zbed4Q80WQ9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Zbed4Q80WQ9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed4Q80WQ9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms