Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ell3Q80VR2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms