Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Avl9Q80U56 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Avl9Q80U56 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms