Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Phf8Q80TJ7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf8Q80TJ7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf8Q80TJ7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf8Q80TJ7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf8Q80TJ7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf8Q80TJ7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf8Q80TJ7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf8Q80TJ7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf8Q80TJ7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf8Q80TJ7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf8Q80TJ7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf8Q80TJ7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms