Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT37

Elp1, Elongator complex protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp1Q7TT37 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Elp1Q7TT37 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Elp1Q7TT37 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Elp1Q7TT37 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Elp1Q7TT37 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Elp1Q7TT37 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Elp1Q7TT37 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Elp1Q7TT37 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Elp1Q7TT37 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Elp1Q7TT37 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Elp1Q7TT37 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Elp1Q7TT37 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Elp1Q7TT37 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Elp1Q7TT37 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Elp1Q7TT37 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Elp1Q7TT37 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Elp1Q7TT37 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Elp1Q7TT37 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Elp1Q7TT37 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Elp1Q7TT37 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Elp1Q7TT37 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms