Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rexo1Q7TT28 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rexo1Q7TT28 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms