Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms