Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms