Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec18aQ7TSQ1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms