Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN98

Cpeb4, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpeb4Q7TN98 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpeb4Q7TN98 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb4Q7TN98 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms