Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shq1Q7TMX5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shq1Q7TMX5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shq1Q7TMX5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shq1Q7TMX5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shq1Q7TMX5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shq1Q7TMX5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shq1Q7TMX5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shq1Q7TMX5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shq1Q7TMX5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shq1Q7TMX5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shq1Q7TMX5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shq1Q7TMX5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shq1Q7TMX5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shq1Q7TMX5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shq1Q7TMX5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shq1Q7TMX5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shq1Q7TMX5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shq1Q7TMX5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Shq1Q7TMX5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shq1Q7TMX5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shq1Q7TMX5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Shq1Q7TMX5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shq1Q7TMX5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shq1Q7TMX5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shq1Q7TMX5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shq1Q7TMX5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shq1Q7TMX5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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