Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scn4bQ7M729 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn4bQ7M729 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms