Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdcl2Q78Y63 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms