Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snd1Q78PY7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms