Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWU9

Rps27, 40S ribosomal protein S27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27Q6ZWU9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27Q6ZWU9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms