Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssx9Q6XAS3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ssx9Q6XAS3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Ssx9Q6XAS3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssx9Q6XAS3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssx9Q6XAS3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssx9Q6XAS3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssx9Q6XAS3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssx9Q6XAS3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssx9Q6XAS3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssx9Q6XAS3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssx9Q6XAS3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssx9Q6XAS3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssx9Q6XAS3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssx9Q6XAS3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssx9Q6XAS3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssx9Q6XAS3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssx9Q6XAS3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssx9Q6XAS3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssx9Q6XAS3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssx9Q6XAS3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssx9Q6XAS3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssx9Q6XAS3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssx9Q6XAS3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssx9Q6XAS3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssx9Q6XAS3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssx9Q6XAS3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssx9Q6XAS3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssx9Q6XAS3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssx9Q6XAS3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssx9Q6XAS3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssx9Q6XAS3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssx9Q6XAS3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssx9Q6XAS3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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